Odpowiada za 2/3 całkowitego utleniania związków węgla.
CO2 otrzymywany z grupy acetylowej jest wydalany jako produkt zbędny; niektóre atomy tlenu w CO2 pochodzą z H2O.
NADH+H+ i FADH2 przekazują protony i elektrony na łańcuch oddechowy.
Energia zmagazynowana w wysokoenergetycznych elektronach NADH+H+ i FADH2 jest wykorzystywana do syntezy ATP z ADP podczas fosforylacji oksydacyjnej, która funkcjonuje tylko w warunkach tlenowych.
Istotą cyklu Krebsa jest dostarczenie równoważników przenoszących wysokoenergetyczne elektrony na tlen; z jednego acetyl-CoA powstają 2 CO2, 3 NADH+H+, 1 FADH2 i 1 cz. GTP (lub ATP).
Cykl Krebsa służy generowaniu ATP dzięki dostarczaniu NADH+H+ i FADH2; dostarcza także intermediatów do biosyntez.
Lokalizacja cyklu Krebsa: macierz mitochondrialna; łańcuch oddechowy znajduje się na wewnętrznej błonie mitochondrium.
Do wnętrza mitochondrium musi być dostarczony tlen — ostatni akceptor elektronów.